La Secretaría de ICCAT facilita el trabajo que realiza la Comisión. Su organización se muestra en el organigrama que aparece a continuación. La organización viene determinada por aspectos como el mandato de la Comisión, la cantidad de personal y la clasificación y experiencia del personal. Debido a estos factores algunos miembros del personal llevan a cabo diferentes tareas relacionadas con varios departamentos.

Algunas tareas que son coordinadas directamente por el Secretario Ejecutivo o su adjunto no están incluidas en este documento. Algunas de estas tareas son: coordinación de las comunicaciones con los delegados, coordinación de la traducción y distribución de los documentos durante las reuniones y actualización de la página web.