Les thonidés et les istiophoridés sont marqués pour obtenir des informations concernant leurs déplacements, leurs migrations, la structure du stock, leur croissance, la taille de leur population, leur mortalité, leur comportement en banc et leur physiologie, ainsi que pour examiner les effets de différents modes de pêche sur les poissons et sur les pêcheries. Les thonidés et les istiophoridés sont actuellement marqués par de nombreuses organisations différentes dans toutes les régions du monde où ils sont présents, et les pêcheurs et les conserveries de nombreux pays ont donc la possibilité de trouver des poissons marqués. L’ICCAT a mis au point un programme international de marquage en coopération dans l’océan Atlantique et ses mers adjacentes. De nombreux pays membres participent aujourd’hui à ce programme et remettent à l’eau de nombreux thonidés, istiophoridés et espèces apparentées après leur avoir apposé des marques « conventionnelles » ou électroniques de différents types (émetteurs acoustiques, marques-archives, marques-archives pop-up).

Ce programme ne sera couronné de succès que si l’on garantit la collaboration entre les pêcheurs sportifs et l’industrie pour récupérer ces marques. De nombreuses marques retournées ne contenaient pas de données ou comportaient des données incomplètes, ce qui indique la nécessité d’améliorer les systèmes de collecte de l’information requise pour les poissons marqués qui sont récupérés. Il existe d’importantes récompenses associées à la récupération d’un poisson porteur de marque, notamment s’il s’agit d’une marque électronique. Ces récompenses sont versées par l’agence de recherche participant à la campagne de marquage. En outre, afin de promouvoir le retour de marques, l’ICCAT organise des tirages au sort annuels assortis de prix de 500 USD.

Les marques conventionnelles

(Appelées également « marques spaghettis ») sont apposées sur le poisson.
Il existe différents types à utiliser pour différentes tailles de poissons. Les marques portent un numéro de série ainsi qu’une adresse pour que la marque puisse être retournée si elle est trouvée sur un poisson.

Les marques-archives

Sont un type de marques électroniques qui enregistrent des informations pour une récupération ultérieure. Les marques-archives sont implantées de façon interne et disposent d’un capteur de luminosité qui ressort du poisson.

Les marques pop-up

Sont un autre type de marques électroniques. Elles sont apposées de façon externe. Après une période donnée, elles se détachent du poisson et transmettent des informations via satellite.